Polypeptide là các phân tử lớn và mỗi chuỗi polypeptide có tính chất vật lý và hóa học riêng. Một số polypeptide rất khó tổng hợp, một số khác tương đối dễ tổng hợp, nhưng rất khó để tinh chế, chủ yếu là không hòa tan trong nước, vì vậy trong quá trình tinh chế, những peptide kỵ nước đó phải hòa tan trong dung môi không nước hoặc dung dịch đệm đặc biệt, tuy nhiên những dung môi hoặc dung dịch đệm này có thể không phù hợp để áp dụng cho các hệ thống thí nghiệm sinh học, các nhà nghiên cứu không thể sử dụng polypeptide này để đạt được mục đích nghiên cứu.
　　
Sau nhiều năm dò dẫm và tích lũy, các nhà tổng hợp tại Boossen đưa ra một số lời khuyên về thiết kế polypeptide của các nhà nghiên cứu:
　　
Khó khăn.
　　
Giảm chiều dài chuỗi peptide tăng chiều dài dẫn đến giảm độ tinh khiết của sản phẩm thô, peptide có ít hơn 15 dư lượng dễ dàng có được. Khi chuỗi peptide tăng lên hơn 20, lượng sản phẩm bình thường được xem xét. Trong thực tế cụ thể, dư lượng dưới 20 thường cho kết quả tốt hơn.
　　
2. Giảm dư lượng kỵ nước kỵ nước chiếm ưu thế rõ ràng của peptide, đặc biệt là trong khu vực 7-12 dư lượng từ đầu C, sẽ gây khó khăn cho việc tổng hợp, thường được coi là do sự hình thành của tấm gấp beta trong tổng hợp, tạo ra không * ghép nối. Tất nhiên, việc thay thế một số dư lượng phân cực có sẵn hoặc thêm cấu trúc peptide mở Gly hoặc Pro có thể hữu ích.
　　
3. Giảm "khó khăn" dư lượng có nhiều Cys, Met, Arg, Try dư lượng nói chung là khó khăn để tổng hợp. Ser thường có sẵn như là một thay thế không oxy hóa.
　　
Cải thiện khả năng hòa tan
　　
1. Thay đổi peptide axit kết thúc N hoặc C (tích điện âm khi giá trị PH là 7) chúng tôi đề xuất; Đầu C acetyl hóa đầu N duy trì nhóm carboxyl tự do để tăng điện tích âm. Các peptide cơ bản (tích cực ở pH 7) kết thúc bằng cách amino hóa các nhóm amin tự do phân đoạn N để tăng điện tích dương.
　　
2. Trình tự rút ngắn hoặc kéo dài Một số trình tự chứa nhiều axit amin kỵ nước như Trp, Phe, Val, Ile, Leu, Met,
　　
Tyr, Ala, v.v. thường khó hòa tan khi những dư lượng kỵ nước này lớn hơn 50%. Để tăng độ phân cực của peptide, chuỗi kéo dài có thể hữu ích. Một lựa chọn khác là giảm chiều dài của chuỗi peptide để tăng độ phân cực bằng cách giảm dư lượng kỵ nước. Phân cực chuỗi peptide càng cao, càng có nhiều khả năng hòa tan trong nước.
　　
3. Thêm dư lượng hòa tan cho một số axit amin phân cực có thể cải thiện tính hòa tan. Peptide axit có thể được thêm vào đầu N hoặc C
　　
Glu-Glu. Các peptide kiềm có thể được thêm Lys-Lys ở đầu N hoặc C. Nếu không thể thêm nhóm tích điện. Ser-Gly-Zer có thể được thêm vào N hoặc C-End. Tuy nhiên, phương pháp này không hoạt động khi hai đầu của chuỗi peptide không thể thay đổi.
　　
4. Bằng cách thay thế một hoặc nhiều dư lượng để thay đổi độ hòa tan của chuỗi peptide trình tự có thể được cải thiện bằng cách thay đổi một số dư lượng của trình tự, nói chung thay thế một dư lượng duy nhất có thể thay đổi đáng kể kỵ nước của nó. Thay đổi này khá bảo thủ, chẳng hạn như thay thế Ala bằng Gly.
　　
Chọn "khung" khác nhau để thay đổi trình tự Nếu bạn có thể sử dụng một trình tự để chuẩn bị nhiều polypeptide nối tiếp hoặc chồng chéo với nhau có chiều dài nhất định, bạn có thể thực hiện mục đích thay đổi trình tự bằng cách thay đổi các điểm bắt đầu polypeptide riêng lẻ. Nguyên tắc là: tạo ra sự cân bằng mới và tốt hơn giữa các dư lượng hydrophilic và hydrophobic của cùng một polypeptide, hoặc đặt các dư lượng "khó khăn" của cùng một polypeptide (như đặt hai Cys) vào hai polypeptide khác nhau thay vì tập hợp trong cùng một phân tử.
　　
Bắc Kinh Boosen Biotechnology Co., Ltd. - Phòng tổng hợp polypeptide