Virus cúm lợn H1N1 thuộc họ protein cúm A H1N1-M2, virus cúm lợn H1N1 giao thoa với rất nhiều loại virus cúm, bao gồm người, gia cầm và rất nhiều động vật có vú có trình tự protein virus tương đối cao: H5N1 H7N9N2H13N6N3H1N1N2N1N2N3N2H2N2 và vẫn đang không ngừng biến đổi.
　　
Virus cúm lợn H1N1 không chỉ có tính đồng nguyên rất cao, mà còn lan rộng đến nhiều quốc gia và vùng lãnh thổ Âu Mỹ, châu Á, bao gồm nhiều tỉnh miền Trung và miền Đông nước Mỹ cũng như khu vực Đông Nam Á như Hồng Kông, Thái Lan. Truyền bá giữa lợn hàng năm đều có, truyền bá giữa người và lợn những năm gần đây có xu hướng tăng lên.